Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TXNDC2Q86VQ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TXNDC2Q86VQ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TXNDC2Q86VQ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TXNDC2Q86VQ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TXNDC2Q86VQ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TXNDC2Q86VQ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TXNDC2Q86VQ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms