Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YTHDF3Q7Z739 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
YTHDF3Q7Z739 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YTHDF3Q7Z739 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YTHDF3Q7Z739 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YTHDF3Q7Z739 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms