Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMC6Q7Z403 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMC6Q7Z403 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMC6Q7Z403 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMC6Q7Z403 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMC6Q7Z403 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms