Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT45

Rragd, Ras-related GTP-binding protein D, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragdQ7TT45 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RragdQ7TT45 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RragdQ7TT45 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RragdQ7TT45 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RragdQ7TT45 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.9 ms