Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec18aQ7TSQ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec18aQ7TSQ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clec18aQ7TSQ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clec18aQ7TSQ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec18aQ7TSQ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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