Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCXQ7RTU7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCXQ7RTU7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SCXQ7RTU7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SCXQ7RTU7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms