Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2E3

DHX30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30Q7L2E3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.083e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 AFDN-209ENST00000400825 963 ntTSL 533.83■■■■□ 3.012e-11■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 KDM4B-205ENST00000588337 504 ntTSL 531.76■■■□□ 2.673e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 AFDN-208ENST00000400824 875 ntTSL 531.45■■■□□ 2.632e-11■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 ECI1-202ENST00000561688 705 ntTSL 231.39■■■□□ 2.623e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.533e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.43e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 DGAT1-207ENST00000531896 981 ntTSL 329.28■■■□□ 2.283e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.223e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 RRBP1-205ENST00000398782 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 228.88■■■□□ 2.213e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 MXI1-207ENST00000453116 803 ntTSL 528.75■■■□□ 2.193e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.063e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.053e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.983e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.943e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.753e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 VILL-206ENST00000463080 831 ntTSL 524.9■■□□□ 1.583e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 DGAT1-204ENST00000525371 840 ntTSL 524.48■■□□□ 1.513e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 TOP1MT-206ENST00000518951 1461 ntTSL 524.22■■□□□ 1.473e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.463e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.392e-11■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 FAM207A-203ENST00000458015 643 ntTSL 523.64■■□□□ 1.373e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.373e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 CDK16-216ENST00000520893 943 ntTSL 523.51■■□□□ 1.353e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 CDK16-217ENST00000522234 1679 ntTSL 222.95■■□□□ 1.263e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 INSIG2-203ENST00000467223 627 ntTSL 522.82■■□□□ 1.242e-11■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 CDK16-208ENST00000517426 1574 ntTSL 522.42■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 PEPD-212ENST00000593163 1045 ntTSL 221.53■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 TOP1MT-207ENST00000519139 1561 ntTSL 521.4■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 SEPT5-214ENST00000480423 563 ntTSL 420.87■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 SEPT11-205ENST00000504637 548 ntTSL 520.82■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.912e-11■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 CDK16-213ENST00000519758 991 ntTSL 320.62■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 SEPT11-210ENST00000510641 1870 ntTSL 1 (best)20.56■□□□□ 0.883e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 VILL-208ENST00000484717 2072 ntTSL 1 (best)20.15■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 INSIG2-202ENST00000411929 574 ntTSL 218.61■□□□□ 0.572e-11■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 CDK16-215ENST00000520295 573 ntTSL 418.11■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 CD81-210ENST00000493525 396 ntTSL 517.73■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 CDK16-209ENST00000517479 520 ntTSL 417.21■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 MYDGF-202ENST00000596031 335 ntTSL 317.1■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 PEPD-204ENST00000588328 581 ntTSL 316.16■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 CDK16-218ENST00000522883 601 ntTSL 416.07■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 CDK16-210ENST00000517997 562 ntTSL 415.43■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-11■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 MYDGF-204ENST00000599761 463 ntTSL 314.5□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 WDR60-203ENST00000444851 2769 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.212e-11■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 INSIG2-206ENST00000485520 3185 ntTSL 513.64□□□□□ -0.232e-11■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 CDK16-204ENST00000457458 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 ACBD6-204ENST00000475338 964 ntTSL 513.4□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 VILL-203ENST00000412008 813 ntTSL 313.33□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 213.33□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 ACBD6-205ENST00000496993 672 ntTSL 512.4□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 PEPD-213ENST00000609145 570 ntTSL 212.2□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 PEPD-205ENST00000588719 484 ntTSL 310.57□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 INSIG2-204ENST00000471186 2100 ntTSL 510.13□□□□□ -0.792e-11■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 INSIG2-201ENST00000245787 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.882e-11■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 PEPD-208ENST00000590731 557 ntTSL 49.32□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 SEPT11-212ENST00000512575 587 ntTSL 48.88□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 HOXB3-213ENST00000552000 466 ntTSL 36.49□□□□□ -1.373e-6■■■■■ 37.6
DHX30Q7L2E3 CAPN15-208ENST00000637507 1482 ntTSL 525.72■■□□□ 1.711e-6■■■■■ 37.4
DHX30Q7L2E3 CTBP1-210ENST00000510739 774 ntTSL 318.84■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 37.1
DHX30Q7L2E3 CTBP1-206ENST00000504784 418 ntTSL 316.55■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 37.1
DHX30Q7L2E3 PLEC-214ENST00000528131 564 ntTSL 322.14■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 37
DHX30Q7L2E3 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 520.61■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 37
DHX30Q7L2E3 PLEC-215ENST00000532346 316 ntTSL 318.11■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 37
DHX30Q7L2E3 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 37
DHX30Q7L2E3 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 37
DHX30Q7L2E3 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 37
DHX30Q7L2E3 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC6.28□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 37
DHX30Q7L2E3 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 419.25■□□□□ 0.676e-6■■■■■ 37
DHX30Q7L2E3 PEAK1-209ENST00000567808 520 ntTSL 324.92■■□□□ 1.582e-6■■■■■ 36.9
Retrieved 100 of 5,617 protein–RNA pairs in 88.3 ms