Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Brd2Q7JJ13 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Brd2Q7JJ13 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Brd2Q7JJ13 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Brd2Q7JJ13 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brd2Q7JJ13 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brd2Q7JJ13 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Brd2Q7JJ13 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brd2Q7JJ13 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brd2Q7JJ13 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Brd2Q7JJ13 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Brd2Q7JJ13 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Brd2Q7JJ13 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brd2Q7JJ13 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd2Q7JJ13 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms