Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snd1Q78PY7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snd1Q78PY7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snd1Q78PY7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms