Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd3eapQ76KJ5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd3eapQ76KJ5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd3eapQ76KJ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd3eapQ76KJ5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd3eapQ76KJ5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd3eapQ76KJ5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd3eapQ76KJ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd3eapQ76KJ5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd3eapQ76KJ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd3eapQ76KJ5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms