Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
SSH2Q76I76 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SSH2Q76I76 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SSH2Q76I76 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SSH2Q76I76 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SSH2Q76I76 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms