Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sned1Q70E20 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sned1Q70E20 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sned1Q70E20 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sned1Q70E20 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sned1Q70E20 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sned1Q70E20 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sned1Q70E20 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sned1Q70E20 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sned1Q70E20 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sned1Q70E20 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sned1Q70E20 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sned1Q70E20 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sned1Q70E20 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sned1Q70E20 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sned1Q70E20 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sned1Q70E20 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sned1Q70E20 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sned1Q70E20 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sned1Q70E20 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sned1Q70E20 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Sned1Q70E20 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sned1Q70E20 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sned1Q70E20 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sned1Q70E20 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sned1Q70E20 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sned1Q70E20 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sned1Q70E20 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sned1Q70E20 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sned1Q70E20 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sned1Q70E20 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sned1Q70E20 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sned1Q70E20 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sned1Q70E20 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms