Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00336Q6ZUF6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00336Q6ZUF6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00336Q6ZUF6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms