Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

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Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP47Q6ZTR5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CFAP47Q6ZTR5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFAP47Q6ZTR5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFAP47Q6ZTR5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
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