Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN12Q6ZSI9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN12Q6ZSI9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN12Q6ZSI9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN12Q6ZSI9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN12Q6ZSI9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN12Q6ZSI9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN12Q6ZSI9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN12Q6ZSI9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN12Q6ZSI9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN12Q6ZSI9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN12Q6ZSI9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN12Q6ZSI9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN12Q6ZSI9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN12Q6ZSI9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPN12Q6ZSI9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN12Q6ZSI9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms