Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC55Q6ZSA7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC55Q6ZSA7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC55Q6ZSA7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC55Q6ZSA7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.7 ms