Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LBX2Q6XYB7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LBX2Q6XYB7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LBX2Q6XYB7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LBX2Q6XYB7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms