Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MUC6Q6W4X9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MUC6Q6W4X9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MUC6Q6W4X9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms