Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXD4L3Q6VB84 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXD4L3Q6VB84 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
FOXD4L3Q6VB84 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXD4L3Q6VB84 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms