Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINGO4Q6UY18 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINGO4Q6UY18 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LINGO4Q6UY18 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINGO4Q6UY18 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINGO4Q6UY18 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINGO4Q6UY18 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINGO4Q6UY18 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINGO4Q6UY18 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LINGO4Q6UY18 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINGO4Q6UY18 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINGO4Q6UY18 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINGO4Q6UY18 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms