Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms