Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNT2Q6UVM3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNT2Q6UVM3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNT2Q6UVM3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNT2Q6UVM3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNT2Q6UVM3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 366.1 ms