Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC171Q6TFL3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC171Q6TFL3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms