Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SAMD1Q6SPF0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SAMD1Q6SPF0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SAMD1Q6SPF0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms