Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd300lfQ6SJQ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd300lfQ6SJQ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd300lfQ6SJQ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd300lfQ6SJQ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd300lfQ6SJQ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd300lfQ6SJQ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd300lfQ6SJQ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd300lfQ6SJQ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd300lfQ6SJQ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd300lfQ6SJQ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms