Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Bms1Q6PGF5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bms1Q6PGF5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bms1Q6PGF5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bms1Q6PGF5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bms1Q6PGF5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bms1Q6PGF5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bms1Q6PGF5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bms1Q6PGF5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bms1Q6PGF5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bms1Q6PGF5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Bms1Q6PGF5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bms1Q6PGF5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bms1Q6PGF5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Bms1Q6PGF5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bms1Q6PGF5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bms1Q6PGF5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bms1Q6PGF5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bms1Q6PGF5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Bms1Q6PGF5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bms1Q6PGF5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Bms1Q6PGF5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Bms1Q6PGF5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Bms1Q6PGF5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Bms1Q6PGF5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bms1Q6PGF5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bms1Q6PGF5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms