Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB66

Lrpprc, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrpprcQ6PB66 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
LrpprcQ6PB66 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
LrpprcQ6PB66 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
LrpprcQ6PB66 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
LrpprcQ6PB66 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
LrpprcQ6PB66 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
LrpprcQ6PB66 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LrpprcQ6PB66 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LrpprcQ6PB66 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
LrpprcQ6PB66 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
LrpprcQ6PB66 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
LrpprcQ6PB66 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
LrpprcQ6PB66 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
LrpprcQ6PB66 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
LrpprcQ6PB66 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
LrpprcQ6PB66 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
LrpprcQ6PB66 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
LrpprcQ6PB66 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
LrpprcQ6PB66 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
LrpprcQ6PB66 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
LrpprcQ6PB66 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
LrpprcQ6PB66 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LrpprcQ6PB66 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
LrpprcQ6PB66 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
LrpprcQ6PB66 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
LrpprcQ6PB66 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LrpprcQ6PB66 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
LrpprcQ6PB66 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
LrpprcQ6PB66 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
LrpprcQ6PB66 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
LrpprcQ6PB66 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
LrpprcQ6PB66 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
LrpprcQ6PB66 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
LrpprcQ6PB66 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
LrpprcQ6PB66 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
LrpprcQ6PB66 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
LrpprcQ6PB66 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
LrpprcQ6PB66 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
LrpprcQ6PB66 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
LrpprcQ6PB66 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
LrpprcQ6PB66 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
LrpprcQ6PB66 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
LrpprcQ6PB66 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
LrpprcQ6PB66 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
LrpprcQ6PB66 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
LrpprcQ6PB66 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
LrpprcQ6PB66 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
LrpprcQ6PB66 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
LrpprcQ6PB66 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
LrpprcQ6PB66 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
LrpprcQ6PB66 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
LrpprcQ6PB66 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
LrpprcQ6PB66 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
LrpprcQ6PB66 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
LrpprcQ6PB66 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
LrpprcQ6PB66 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LrpprcQ6PB66 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LrpprcQ6PB66 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
LrpprcQ6PB66 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
LrpprcQ6PB66 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
LrpprcQ6PB66 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
LrpprcQ6PB66 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
LrpprcQ6PB66 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
LrpprcQ6PB66 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
LrpprcQ6PB66 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
LrpprcQ6PB66 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
LrpprcQ6PB66 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
LrpprcQ6PB66 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
LrpprcQ6PB66 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LrpprcQ6PB66 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LrpprcQ6PB66 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
LrpprcQ6PB66 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LrpprcQ6PB66 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LrpprcQ6PB66 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
LrpprcQ6PB66 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
LrpprcQ6PB66 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
LrpprcQ6PB66 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
LrpprcQ6PB66 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
LrpprcQ6PB66 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
LrpprcQ6PB66 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
LrpprcQ6PB66 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
LrpprcQ6PB66 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
LrpprcQ6PB66 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LrpprcQ6PB66 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LrpprcQ6PB66 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LrpprcQ6PB66 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
LrpprcQ6PB66 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LrpprcQ6PB66 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
LrpprcQ6PB66 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
LrpprcQ6PB66 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
LrpprcQ6PB66 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
LrpprcQ6PB66 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
LrpprcQ6PB66 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
LrpprcQ6PB66 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
LrpprcQ6PB66 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
LrpprcQ6PB66 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
LrpprcQ6PB66 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
LrpprcQ6PB66 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
LrpprcQ6PB66 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LrpprcQ6PB66 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms