Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhb9Q6PB60 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bhlhb9Q6PB60 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhb9Q6PB60 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms