Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rexo4Q6PAQ4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rexo4Q6PAQ4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rexo4Q6PAQ4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms