Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAI4

Lce3f, Late cornified envelope 3F, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3fQ6PAI4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Lce3fQ6PAI4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Lce3fQ6PAI4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms