Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AtminQ6P9S1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AtminQ6P9S1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AtminQ6P9S1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AtminQ6P9S1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
AtminQ6P9S1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AtminQ6P9S1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AtminQ6P9S1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AtminQ6P9S1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtminQ6P9S1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms