Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8Y7

Snx31, Sorting nexin-31, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx31Q6P8Y7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx31Q6P8Y7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx31Q6P8Y7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx31Q6P8Y7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx31Q6P8Y7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms