Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Podnl1Q6P3Y9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Podnl1Q6P3Y9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Podnl1Q6P3Y9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Podnl1Q6P3Y9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Podnl1Q6P3Y9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Podnl1Q6P3Y9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Podnl1Q6P3Y9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Podnl1Q6P3Y9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Podnl1Q6P3Y9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Podnl1Q6P3Y9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Podnl1Q6P3Y9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Podnl1Q6P3Y9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Podnl1Q6P3Y9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Podnl1Q6P3Y9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Podnl1Q6P3Y9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Podnl1Q6P3Y9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Podnl1Q6P3Y9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms