Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casc4Q6P2L7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Casc4Q6P2L7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Casc4Q6P2L7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casc4Q6P2L7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casc4Q6P2L7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casc4Q6P2L7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc4Q6P2L7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc4Q6P2L7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc4Q6P2L7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc4Q6P2L7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casc4Q6P2L7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc4Q6P2L7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc4Q6P2L7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc4Q6P2L7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc4Q6P2L7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Casc4Q6P2L7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 519.1 ms