Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnpo3Q6P2B1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo3Q6P2B1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tnpo3Q6P2B1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnpo3Q6P2B1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms