Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rtl3Q6P1Y1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtl3Q6P1Y1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtl3Q6P1Y1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms