Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bfsp2Q6NVD9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bfsp2Q6NVD9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bfsp2Q6NVD9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bfsp2Q6NVD9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms