Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP4R4Q6NUP7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP4R4Q6NUP7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP4R4Q6NUP7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms