Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
APOBEC3HQ6NTF7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
APOBEC3HQ6NTF7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
APOBEC3HQ6NTF7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
APOBEC3HQ6NTF7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms