Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Pdcd11Q6NS46 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Pdcd11Q6NS46 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pdcd11Q6NS46 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pdcd11Q6NS46 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Pdcd11Q6NS46 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pdcd11Q6NS46 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Pdcd11Q6NS46 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Pdcd11Q6NS46 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Pdcd11Q6NS46 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pdcd11Q6NS46 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pdcd11Q6NS46 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pdcd11Q6NS46 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pdcd11Q6NS46 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pdcd11Q6NS46 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pdcd11Q6NS46 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Pdcd11Q6NS46 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Pdcd11Q6NS46 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Pdcd11Q6NS46 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pdcd11Q6NS46 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pdcd11Q6NS46 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pdcd11Q6NS46 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pdcd11Q6NS46 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pdcd11Q6NS46 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pdcd11Q6NS46 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pdcd11Q6NS46 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pdcd11Q6NS46 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pdcd11Q6NS46 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Pdcd11Q6NS46 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Pdcd11Q6NS46 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Pdcd11Q6NS46 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Pdcd11Q6NS46 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Pdcd11Q6NS46 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Pdcd11Q6NS46 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Pdcd11Q6NS46 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Pdcd11Q6NS46 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pdcd11Q6NS46 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pdcd11Q6NS46 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pdcd11Q6NS46 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pdcd11Q6NS46 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pdcd11Q6NS46 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Pdcd11Q6NS46 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Pdcd11Q6NS46 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Pdcd11Q6NS46 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Pdcd11Q6NS46 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Pdcd11Q6NS46 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Pdcd11Q6NS46 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Pdcd11Q6NS46 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pdcd11Q6NS46 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pdcd11Q6NS46 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pdcd11Q6NS46 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pdcd11Q6NS46 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pdcd11Q6NS46 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Pdcd11Q6NS46 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms