Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TYW3Q6IPR3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TYW3Q6IPR3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TYW3Q6IPR3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TYW3Q6IPR3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TYW3Q6IPR3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TYW3Q6IPR3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms