Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBS0

TWF2, Twinfilin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF2Q6IBS0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TWF2Q6IBS0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TWF2Q6IBS0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TWF2Q6IBS0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TWF2Q6IBS0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TWF2Q6IBS0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWF2Q6IBS0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWF2Q6IBS0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TWF2Q6IBS0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TWF2Q6IBS0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TWF2Q6IBS0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TWF2Q6IBS0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWF2Q6IBS0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWF2Q6IBS0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWF2Q6IBS0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TWF2Q6IBS0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms