Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms