Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cdk13Q69ZA1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cdk13Q69ZA1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cdk13Q69ZA1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cdk13Q69ZA1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cdk13Q69ZA1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cdk13Q69ZA1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cdk13Q69ZA1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Cdk13Q69ZA1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk13Q69ZA1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cdk13Q69ZA1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cdk13Q69ZA1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cdk13Q69ZA1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Cdk13Q69ZA1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cdk13Q69ZA1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cdk13Q69ZA1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Cdk13Q69ZA1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cdk13Q69ZA1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cdk13Q69ZA1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cdk13Q69ZA1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cdk13Q69ZA1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cdk13Q69ZA1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cdk13Q69ZA1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cdk13Q69ZA1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cdk13Q69ZA1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cdk13Q69ZA1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cdk13Q69ZA1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cdk13Q69ZA1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cdk13Q69ZA1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cdk13Q69ZA1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cdk13Q69ZA1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cdk13Q69ZA1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cdk13Q69ZA1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cdk13Q69ZA1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cdk13Q69ZA1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cdk13Q69ZA1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cdk13Q69ZA1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cdk13Q69ZA1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cdk13Q69ZA1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cdk13Q69ZA1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Cdk13Q69ZA1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cdk13Q69ZA1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cdk13Q69ZA1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cdk13Q69ZA1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Cdk13Q69ZA1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Cdk13Q69ZA1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Cdk13Q69ZA1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cdk13Q69ZA1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cdk13Q69ZA1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Cdk13Q69ZA1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cdk13Q69ZA1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cdk13Q69ZA1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cdk13Q69ZA1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cdk13Q69ZA1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cdk13Q69ZA1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cdk13Q69ZA1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cdk13Q69ZA1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cdk13Q69ZA1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cdk13Q69ZA1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cdk13Q69ZA1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cdk13Q69ZA1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdk13Q69ZA1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms