Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Papd5Q68ED3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Papd5Q68ED3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Papd5Q68ED3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Papd5Q68ED3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms