Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VclQ64727 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VclQ64727 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VclQ64727 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VclQ64727 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VclQ64727 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VclQ64727 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VclQ64727 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VclQ64727 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VclQ64727 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VclQ64727 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VclQ64727 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VclQ64727 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VclQ64727 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VclQ64727 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VclQ64727 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VclQ64727 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VclQ64727 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VclQ64727 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VclQ64727 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VclQ64727 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VclQ64727 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VclQ64727 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VclQ64727 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VclQ64727 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VclQ64727 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VclQ64727 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VclQ64727 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VclQ64727 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VclQ64727 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VclQ64727 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VclQ64727 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VclQ64727 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VclQ64727 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VclQ64727 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VclQ64727 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VclQ64727 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VclQ64727 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VclQ64727 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VclQ64727 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VclQ64727 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VclQ64727 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VclQ64727 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VclQ64727 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VclQ64727 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VclQ64727 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VclQ64727 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VclQ64727 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VclQ64727 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VclQ64727 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VclQ64727 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VclQ64727 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VclQ64727 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VclQ64727 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VclQ64727 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VclQ64727 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VclQ64727 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VclQ64727 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VclQ64727 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VclQ64727 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VclQ64727 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VclQ64727 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VclQ64727 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VclQ64727 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VclQ64727 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VclQ64727 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VclQ64727 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VclQ64727 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VclQ64727 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VclQ64727 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VclQ64727 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VclQ64727 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VclQ64727 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VclQ64727 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VclQ64727 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VclQ64727 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VclQ64727 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VclQ64727 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VclQ64727 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VclQ64727 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VclQ64727 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VclQ64727 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VclQ64727 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VclQ64727 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VclQ64727 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VclQ64727 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VclQ64727 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VclQ64727 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VclQ64727 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VclQ64727 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VclQ64727 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VclQ64727 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VclQ64727 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VclQ64727 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VclQ64727 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VclQ64727 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VclQ64727 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VclQ64727 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VclQ64727 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VclQ64727 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms