Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptpn13Q64512 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn13Q64512 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn13Q64512 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn13Q64512 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn13Q64512 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn13Q64512 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptpn13Q64512 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptpn13Q64512 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptpn13Q64512 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn13Q64512 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn13Q64512 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn13Q64512 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn13Q64512 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptpn13Q64512 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn13Q64512 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn13Q64512 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptpn13Q64512 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptpn13Q64512 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms