Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr2e1Q64104 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nr2e1Q64104 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr2e1Q64104 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr2e1Q64104 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr2e1Q64104 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms