Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps72Q62481 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps72Q62481 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vps72Q62481 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps72Q62481 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps72Q62481 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms