Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxa13Q62424 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxa13Q62424 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hoxa13Q62424 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxa13Q62424 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxa13Q62424 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
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